李香琴出身大戶人家,祖父在廣東和澳門一帶開海產店和米舖,琴姐早年隨父親舉家遷往澳門定居。李父共有五位太太,琴姐是家中長女,有兩個妹妹和兩個弟弟,對家人一向照顧有加。琴姐弟弟李樹佳於1996年在澳門賭錢欠下數百萬賭債,琴姐代弟弟還過百萬後,他死性不改,最後琴姐登報脫離姊弟關係。李樹佳之後改揸的士,還被揭發是養子。
琴姐17歲認識粵劇小生蕭仲坤,1950年結婚,誕下女兒蕭紫筠,但婚姻只維持七年。琴姐一直沒有再婚,但她曾自爆1967年香港暴動,因想移民美國,曾與師傅、盧冠廷父親盧海天在美國假結婚。琴姐多年來與譚炳文被大家認定是一對,她在2008年接受訪問澄清並無拍拖,她指回流返港後認識炳哥,兩人一同登台及合作成立影片公司,所以傳緋聞。後來炳哥突然向琴姐表示,因為太太呷醋,所以不要再做拍檔,但同時又有傳琴姐要求炳哥離婚,琴姐堅決否認此事,後來兩人繼續有合作。