航空公司的航班大大減少，對僅餘還有上班的員工，被指為削減成本而防疫裝備不足。早前國泰一度派沒有中層熔噴布的口罩，也不容許空姐戴眼罩。有空姐指除了自備口罩外，也沒有甚麼能夠做，只能祈求航機上沒有染病乘客，事後自我隔離14日。
港航空姐：得KFC嗰種手套
港龍空姐指出，公司會派發藍色的保護衣、口罩、眼罩、手套。至於財困多時的香港航空，空姐王小姐指公司沒有提供防疫用具，「公司冇錢呀，得KFC嗰隻藍色手套，口罩都冇提供；所以喺架飛機度，會見到空姐戴住唔同款式嘅口罩、眼罩」。
機師不需要接觸乘客，留在獨立的駕駛艙，外界以為很安全，不過有港人機師指出，機師其實十分高危，因他們在機艙內不能戴口罩，「因為有條例規定，機師必須在十秒內戴上氧氣罩呼吸，如果戴口罩，會阻慢戴氧氣罩速度」。同行機師、副機師關在同一狹小空間裏，如果一人受感染，另一人可說一定會被傳染；港人機師擔心，很多外國機師的防疫意識低，受感染機會較大。
不少航空從業員批評政府罔顧他們的安全：「需要我哋時就講要顧及經濟，遲遲唔封關，令到前線人員要接觸遊客，變成高危工作；但又一啲補貼畀航空公司員工都冇，即使連醫護都唔夠裝備，所有資源畀晒警隊，個個行業都喺度捱緊，只有警隊無憂無慮，還要我們相信政府嗎？」