Zoom雖然極力強調注重保安，但成立以來亦出過不少漏洞。程式2018年11月被揭可容無權限的攻擊者遙距主持別人的會議，移除出席者、揑造訊息和騎劫分享畫面。去年7月，程式在Mac作業系統又出問題，黑客網可強行登入用戶戶口，開啟攝影機窺視一切；就算刪掉程式，秘密伺服器亦會自行再下載。
關注電子版權的電子前線基金會亦列出Zoom多項涉侵犯私隱的做法，網址和開會紀錄等用戶數據在管理台固然一覽無遺，會議主持權限亦有過界，無論與會者畫面是否開啟，主持都可藉分享功能監察所有人的活動。
籲政府官員不應用Zoom開會
網絡顧問克盧利坦言Zoom對保安態度輕率，「很多事例令人質疑他們是否了解用戶私隱和保安」。專家提醒新手舉行網上公開聚會時，主持應禁止他人分享畫面，與會者亦應先關掉預設的「文件傳送」功能，以防有心人散播病毒軟件。政府人員亦不應用Zoom開會，英國薩里大學電腦科學教授伍德沃德說：「如果是首相府公告當然沒問題，但我參與過的官員密會都是用Microsoft Teams。這不代表最新版本的Zoom有任何問題，但在這非常時期，最好還是使用身經百戰的視像系統。」
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