武漢肺炎利用與沙士相同的受體入侵細胞後，細胞內的生命周期有可能與沙士類似。現時正在使用和將會進行臨床測試的治療選項，均針對病毒的生命周期中的不同階段，從而抑制病毒複製。
冠狀病毒入侵人體細胞後，就會展開自我複製的工作。病毒的蛋白會先被拆散分解，從而在細胞內釋放病毒RNA（相等於動物的DNA） ，並製造出病毒RNA複製酶。細胞的各種機能和資源會被「騎劫」，配合病毒RNA複製酶不斷複製病毒RNA，並且製造大量新的病毒蛋白。新的病毒蛋白和新的病毒RNA會在細胞內重組成新的冠狀病毒，並被釋放出細胞外，入侵體內其他細胞甚至傳染其他人。
夏天有利產生抗體 紓緩冬疫
現時香港主要混合使用抗愛滋藥洛匹那韋（Lopinavir）、抗病毒藥利巴韋林（Ribavirin）和干擾素治療武漢肺炎。當中洛匹那韋能阻止病毒製造RNA複製酶，利巴韋林則能假扮病毒RNA的原料Guanosine，令RNA複製酶無法成功複製RNA。但相關的治療效果仍有待驗證，根據《美國醫學會期刊》的報告，新加坡方面曾用洛匹那韋治療五個武漢肺炎重症患者，有三人在三日內情況好轉，減少氧氣治療的需要，當中兩人的鼻腔樣本更在二至五日內轉陰性。但其餘兩個病人的情況卻惡化。
新研發的抗病毒藥瑞德西韋（Remdesivir）被視為新希望。瑞德西韋功能與利巴韋林相似，能假扮病毒RNA的另一種原料Adenosine，從而遏止RNA複製。中國研究員刊登在《自然》的研究顯示，實驗室環境內，瑞德西韋能「非常有效」地控制武肺病毒入侵。美國方面亦曾以瑞德西韋治療當地首個確診患者，病人用藥翌日就立刻退燒，各種症狀得到改善。各地的相關臨床測試仍在進行中。
另外，倫敦帝國學院的研究員聯同一英國人工智能公司，聲稱利用人工智能技術，發現類風濕性關節炎藥Baricitinib有可能阻止武肺病毒入侵細胞，相關結果已在《刺針》刊登。但袁國勇對此發現表示有保留，因類風濕性關節炎很可能會壓抑免疫系統，「咁樣好大鑊，因為你係需要你嘅免疫系統去打嗰隻病毒。𠵱家你打唔到，一停藥（病毒）就出返嚟。」
專家預期，武漢肺炎疫情很大可能會持續多年，因此治療以外，研發疫苗以預防感染病毒亦十分重要。多國團隊正各自研發武肺疫苗，包括港大微生物學系。袁國勇指，疫苗仍在動物測試階段，「去到藥廠數據起碼都要等一年至年半先有。」
雖然藥物和疫苗的研究正如火如荼地進行，袁國勇卻奉勸港人不應抱太大期望，因有關的供應難以滿足全球需求：「就算你做到嗰隻藥有用，你攞唔攞到先？你口罩都攞唔到，你點解會攞到藥呢？就算有疫苗，點解要畀香港先？點解唔係第二個國家先？」
袁國勇認為，要令大部份人對武漢肺炎有抗體，始終要依賴天然免疫。他表示，若夏天後社區沒有病例，港人除下口罩，令病毒互相傳播，被感染的人因夏天免疫系統較好，病情會相對輕微，同時部份人在這過程中會對武肺病毒產生天然免疫力，最終達至七至八成人產生抗體，這樣冬天的疫情就會紓緩，但免疫力較弱的長者則依然會有風險。