黃秋生和太太吳惠貞於1992年結婚,育有兩子黃睿名和黃煜政。去年秋生爆出早年出軌撻着岑建勳外甥女Joyce,生下兒子William。秋生直言因工作而錯過兒子成長:「佢哋唔使老竇陪,我咁鬼惡,佢哋需要我時喺度就得,父親係……背影嚟,睇阿爸面目太清楚冇用㗎。」秋生自言給兒子很大自由度:「生佢出嚟,唔通屬於你咩?」
三子中誰最似秋生?他說:「個個都有啲,大仔似𠵱家嘅我好冷靜,鍾意煮餸,好主觀,巴之閉做大佬,情緒脾氣大,佢心地好,好肯幫人。二仔就似我儍,輕信人,好天真,佢仲係好模糊,冇方向感,唔知自己想點,我唔會導航佢,要佢自己搵方向。細仔William好gentle,呢樣我唔及佢,佢斯文到英國佬咁,有探索精神,鍾意大自然,一個人周圍走,獨自去冰天雪地過幾日。」秋生說自己不是一個好爸爸:「我只係一個好人啫,都係做仔好,唔使煩,乜都阿媽搞晒,發脾氣又得,點都得,我都無恥咗一世。」