【立場差異】有評論認為，特朗普起初任用博爾頓是為了清除前朝政策，如今明年大選將至，想競逐連任的特朗普有意拼政績，尋求外交突破，在他而言就是與敵國建立友好關係，博爾頓無疑成為絆腳石。
雖然特朗普與博爾頓在很多問題不咬弦，不過兩人均想退出奧巴馬政府於2015年達成的伊朗核協議。2018年初，特朗普因想退出協議而被幕僚圍攻。博爾頓則比特朗普更討厭該協議，在霍士新聞台闡述立場。去年3月他獲特朗普最大金主之一、金沙賭場大亨艾德森（Sheldon Adelson）推薦下上任。兩個月內美國即退出伊朗核協議，走上「極限施壓」之路。博爾頓甚至游說特朗普退出與俄羅斯簽訂的《中程導彈條約》。
漠視程序「拆牆鬆綁」
分析指博爾頓漠視許多推行政策的既定程序，為特朗普「拆牆鬆綁」，是他得以比前任留任多時的原因。惟他與特朗普在多項議題上立場差異太大。美國智庫布魯金斯學會歐美中心總監賴特（Thomas Wright）說：「特朗普的計劃很明顯：與魯哈尼會面、與北韓達成協議、與塔利班達成協議。博爾頓是他達成目標最主要的障礙。」
英國《衞報》