吳建民近年最廣為人知的事情要數他與《環球時報》總編輯胡錫進就中國外交政策立場引起的筆戰，吳於3月底一場演講中批評《環時》經常發表極端文章，胡錫進隨後還擊指吳是典型的鴿派。
《環時》老總轟典型鴿派
吳建民於3月30日就「準確認識今天的世界」為題演講，當中他談及《環時》發表的文章經常都很極端，並指胡錫進貴為報社主編，很有學問，但沒有把握大局，胡不久後就公開反駁吳建民代表着少數中國舊外交官的思維，指吳是「典型鴿派」，受了委屈還處處息事寧人，但對國內媒體的「民族主義」卻很鷹。胡錫進昨午2時許亦發微博，稱「清早驚悉吳建民大使因車禍離世，深為震動……吳大使與我有過論爭，然而我相信，多元觀點並存是中國社會最寶貴的正元素之一。願仙逝的吳大使走好。」
不單胡錫進，吳建民亦曾於2014年與解放軍少將羅援在電視節目就「當下中國如何與世界打交道」舌戰，當時吳指「在和平與發展為主的時代，誰舉起戰爭的旗幟誰倒大霉，你看美國就是這樣。」當時這場辯論被視為中國「鴿派」與「鷹派」的論戰。吳事後指，「我相信真理。戰爭不能解決問題。」
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