《霍金：愛的方程式》只提及了霍金愛的故事中美好的一面，但其實霍金兩段婚姻均失敗收場。
霍金與首任妻子珍邂逅於劍橋大學譜出戀曲，可惜兩人愛得火熱時卻天意弄人，他於21歲時被診斷患上俗稱「漸凍人症」的肌肉萎縮性脊髓側索硬化症，健康雖每下愈況，但珍卻對霍金不離不棄，更決心長相廝守。兩人結髮25年共育有三名子女，但於1990年仍是離婚收場，之後霍金於1995年迎娶擔任私人看護的伊萊恩。2004年英國有傳媒報道霍金遭伊萊恩虐打，當時霍金透過劍橋大學發聲明澄清，消息轟動全球。對於霍金身上多處受傷，霍金的女兒露西受訪時亦稱2000年曾發現父親身上有傷痕，其父卻稱只是自己不小心弄傷。後來伊萊恩跟霍金也是走到了盡頭，於2006年尾辦理離婚手續。
霍金前年曾接受雜誌訪問，當被問到甚麼令他思考最多？霍金毫無疑問回答：「女人！」形容遇過的女人也令他無法理解。