【爭議不斷】
廣深港高鐵香港段的工程由審批撥款至動工都爭議不斷，其中一個最荒謬之處就是以669億元天價建造費興建一條限速的高鐵。高鐵香港段全長僅26公里，且全程用地底隧道，故根本不能發揮高速特性，最高車速低於每小時200公里，跟普通鐵路無異，與內地段的每小時350公里有相當距離，加上政府漠視其他方案，堅持總站建於西九龍，令走線加長，成本大增，被批是面子工程。
被質疑討好中央
港府早於2001年已跟內地當局探討在港興建與內地接軌的高速鐵路可行性。內地近年全速發展高鐵網絡，去年因受賄及濫權等罪名被判死刑的鐵道部前部長劉志軍在任時大規模興建高鐵，而廣深港高鐵內地段於2011年底已成功通車。港府09年落實興建高鐵香港段，對外宣稱是加強與內地接軌，避免香港被邊緣化，但同時被質疑是融合中港兩地、討好中央的手段。
高鐵另一重大爭議是會途經的石崗菜園村，當時政府決定以20億元向地主收地拆村，但不少村內的非原居民拒遷出，引起社會關注，有80後青年組成關注組力撐村民。雖然最後菜園村要遷走，但連串抗爭壯大了之後的本土社會運動。
2010年1月，立法會財務委員審議撥款申請，最終在保皇黨議員護航下獲通過。當晚有逾萬名市民及反高鐵人士包圍立法會抗議，群情洶湧，時任運房局局長鄭汝樺會後被困立法會六小時後，在警員保護下乘港鐵落荒而逃。
《蘋果》記者