紐約鼠患嚴重，估計有多達2,800萬隻老鼠住在地鐵隧道內，風暴過後，紐約人都關注老鼠下場，擔心大量雨水湧入地鐵隧道，會令老鼠隨洪水湧上地面，但專家指，由於洪水來得太急，很多老鼠都來不及逃生被淹死，反而減輕了鼠患。
齧齒目動物學家表示，洪水湧入地鐵隧道時太猛，相信有成千上萬老鼠被淹死(圖)，當中主要是不熟水性的幼鼠。紐約市衞生部亦指，風災後街上老鼠並沒增加，意味「很多幼鼠被淹死，老鼠數目減少了」。
有疾病生態學家卻指，老鼠擅長游泳，淹死的並不多，牠們在垃圾堆找食物，容易傳播細螺旋體病、沙門氏菌等疾病，而隨水漂流的鼠屍亦會引起鼠疫。專家指，倖存鼠群暫會在新環境過活，但水退後會嘗試回到老家，但相信數量「不會比原來多」。英國《每日郵報》