勞工處僱員補償科可協助因工受傷或患有職業病的僱員，在《僱員補償條例》規定下獲得補償。當有爭議時協助僱主與僱員調解，但不能裁決彼此間的爭議；若未成功解決須交由法院審理。
補償科處理有懷疑個案時，會先向僱員索取口供或病假紙等資料，亦會要求僱員授權該科向有關部門及機構如醫管局所發之醫療報告。需要時或向勞工處醫生索取醫學意見。由於每宗個案的情況各異，在處理有懷疑的工傷或職業病個案調查時間亦不限。僱員欲了解個案調查進度，可與分區補償科直接查詢。
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