上水分區警署現址粉嶺沙頭角公路及馬會道交界，於70年代啟用，其旁邊是工廠區，前身是粉嶺安樂村，據一名研究北區歷史的老村民張先生說，日軍在二次大戰侵佔香港期間，經羅湖沿上水、粉嶺向市區推進，曾佔領原本是佈滿大宅、書室的安樂村作憲兵分部，在該處審問犯人和擺放軍事設施等。
張指出，上水警署原址是農地，對開約20米的迴旋處當年是日軍刑場，而安樂村對面約200米的田野是亂葬崗。張推測，日軍入村難免殺害村民，屍體埋葬在農地也不足為奇。張又提及，在《香港民間風土記憶》一書中，有一張日軍離開粉嶺安樂村的照片（圖），相中左邊正上水警署所在地，中間泥路即現時警署旁的石屎路。