台灣高等法院認定陳水扁國務機要費案不涉及貪污，主要依據是其經手的21項機密外交資料都是真的，且總支出遠超過控方起訴金額，故認定扁是因公支出完畢，不涉貪污。法庭並認同機要費部份事項須秘密進行，不便以收據報領。此外，合議庭曾秘密傳召民運人士王丹等出庭作證。
審判長沈宜生昨日見記者時表示：「我們查得很清楚。」他指，法庭判決書共200多頁，其中有165頁記載扁從事21項機密外交支出。他又指因事涉機密，故判決只能以代號記載，但都有註明出處，全都是有憑有據。
李登輝：我不知道
民進黨立委柯建銘指，國務機要費最早名稱就是特別費，後來才改為國務機要費，「各地首長都有特別費，難道總統不應有國務機要費嗎？」民進黨立委高志鵬指，國民黨主導將首長特別費除罪化，但國務機要費例外，這是明顯針對陳水扁。
國民黨立委邱毅則指，國務機要費案最早是他揭發，當時他拿了上千張發票檢舉陳水扁，「用別人的發票詐領國務機要費，做私人用途，如果這不叫貪污，那司法機關可以關門大吉了！」前總統李登輝則說：「司法的事我不知道，交給司法去處理。」
台灣《蘋果日報》