吸取反高鐵抗爭及東亞運被評嚴重超支等經驗，據悉，政府與機管局就是否興建第三條跑道的諮詢花盡心思，包括提供以今天成本計算的總投資額及計入未來10至20年通脹後的總投資額，並詳述維持現狀與興建第三條跑道的利弊，刺激社會各界討論，以免只得反對聲音。
總投資額料1200億
消息指，機管局預計機場興建第三條跑道的總投資額達900億元，包括填海及改裝二號客運大樓，如增設行李系統、無人駕駛鐵路及出入境系統等。
考慮到最快今年底才有諮詢結果，之後做的環評報告需時1至1年半，若拍板，第三條跑道最快2013或2014年才動工，屆時建築費用可能上升，故機管局按政府估計未來10至20年每年通脹3%至5%，計出最終的投資額約1200億至1300億元，讓市民有預算，免得新跑道建成後被責超支。
此外，諮詢文件特別提到機場維持現狀與新增跑道的利弊，因為如果只提議興建第三條跑道，在現今社會環境，反對聲音會輕易掩蓋贊成聲音；假如讓人覺得有得選擇，反而可以引起市場積極討論有關議題。