嗇色園黃大仙祠屬宗教團體及非牟利機構，受民政事務局及華人廟宇委員會監管。黃大仙祠在港歷史可追溯到1915年，廣東省西樵普慶壇梁仁菴及梁鈞轉道長父子將黃大仙畫像帶來香港，設壇安奉黃大仙及贈醫施藥，並於1921年在現址興建黃大仙祠。
嗇色園共有24名董事，當中六名官委，包括黃大仙民政專員、華人廟宇委員會秘書、區議會代表等。現任主席李耀輝07年上任，為退休老差骨，曾被指豪花善款舉行豪華版的黃大仙祠90周年紀念活動。
嗇色園年報公開的賬目顯示，09年「善款收入」逾7,300萬元，佔所有收入約三成；黃大仙祠及嗇色園總部的支出約4,800萬元。
嗇色園近期將黃大仙祠外有數百年歷史的林氏古墓管理權交還政府，並拆除古墓圍牆，惹來林氏後人不滿。