台灣的中央研究院近代史研究所所長黃克武表示，若在史學角度，對民國歷史有影響的，「毛澤東等也算一號人物」，適不適合上榜就要看是從國家定位或歷史角度看。
「國人情何以堪」
黃克武認為，國史館慶祝建國百年，把毛澤東及鄧小平弄上榜，「對國人情何以堪」，而且讓大家票選就會有風險。他更表示：「還好大陸網友沒有發現這網站，不然會去灌水，搞不好毛、鄧票數會上億！」
政治大學台灣史研究所長陳翠蓮表示，拿掉毛澤東、鄧小平其實也沒有必要，事實上他們在民國初年是活躍的，而且文化界的也有，是不是也要拿掉？她認為，重點是看不出來票選活動的目的、定義、規劃不清，「若以當代台灣一百名人票選，就比較清楚」。
有民眾李澤湘認為，中華民國國史館居然將中共共產黨的領導人列為「民國百人」票選活動的候選人，國史館簡直是在「為匪宣傳」，中華民國的先聖先賢難道都沒有人可供紀念？
市民林家妤則稱，國史館太草率了，簡直像小朋友辦家家酒，也讓她懷疑國史館所出版、紀錄史料的正確性。
台灣《蘋果日報》