台灣法務部指，獄中人犯待遇分四級，其中第四級管制最嚴，第一級最輕；陳水扁初入監屬第四級，一周只能和家人會面一次，不能享有私人電視、收音機等福利，故入獄時扁自帶的掌上電視及收音機，都被獄方收回暫時代管。
按規定，第四級人犯需累積滿180分才能進入第三級，第三級可享私人電視、收音機等福利。監獄人員估計，扁要達180分要花好幾年。法務部指基於安全考量，不讓扁下工場和其他受刑人共處，但扁若願意在監舍工作，得分較易。
住「獨居房但非獨居」
外界批評獄方讓陳水扁住單獨監倉享特權。但法學界人士指，法律規定初入監的受刑人要獨居監禁，獨居期限三個月，獄方安排扁住獨居是依法行事；因監倉爆棚，其他新收人犯無法獨居，獄方為阿扁安排室友，一舉兩得。有關人士指，理論上阿扁在獄中身份只是「1020」，但事實上他畢竟是前總統，如在監獄有任何狀況，必然引發風暴。故最穩當的做法，就是讓他住「獨居房但非獨居」，安排一個可以凡事包容扁的人就近照應。台灣《蘋果日報》