雖然高鐵撥款在保皇派議員支持下，成功強行闖過財委會，可是連個別保皇派議員，也批評政府處理高鐵撥款諮詢不足，又未能充份掌握形勢，令反對遷拆菜園村行動越搞越大。有政府中人也承認，今次處理高鐵事件，有不少值得參考經驗，特別是日後處理具爭議項目，不能再只靠傳統諮詢方式。
有泛民立法會議員指出，雖然房屋及運輸局局長鄭汝樺多次親身到菜園村出席諮詢會，又找來身兼行政會議成員的鄉議局主席劉皇發做中間人，以提高賠償方式，滿足菜園村地主要求，可是諮詢過程中，明顯忽略了菜園村居民，以及一班關注保育青年、專業人士意見，令這些反對意見成功合流，越搞越大，明顯是政府策略出了問題。
有政府中人也承認，以往政府處理收地發展，政府將諮詢工作集中於直接受影響人士，就算有少數人堅持反對，只要當中大部份人接受，一樣可以過關，可是今次反高鐵行動顯示，隨着社會保育、公民意識提升，就算只有少數人反對，一樣可以結合社會上其他反對力量，將抗爭行動不斷升級，所以他認為日後政府再處理一些有爭議項目，例如西九發展，應吸收今次經驗，不能再單靠傳統諮詢方法，化解反對意見。
本報記者