政府正免費為兩歲或以下幼童接種肺炎球菌疫苗，並採用一種七價疫苗，即可抵抗七種不同的肺炎球菌，但市面上也有一種十價疫苗，部份家長或會替子女接種兩種不同的疫苗，以加強保護，香港醫院藥劑師學會則指，未有科學數據顯示有關注射方法可提高保護性，建議家長選用同一牌子的疫苗。
兩歲以下幼童會視乎年齡，接種一至四針肺炎球菌疫苗，初生嬰兒則在六個月內注射三針，1歲後接種加強劑。現時政府的肺炎球菌接種計劃正使用七價疫苗（Prevenar），曾有報道指使用十價疫苗（Synflorix）作為加強劑，即3+1接種方法，可得到更廣泛的保護。
不過香港醫院藥劑師學會重申，臨床研究顯示3+1方法的保護效用較四針同一疫苗為低，更未有足夠數據支持可提高對中耳炎的預防，故建議使用同一牌子的疫苗，以達最佳的保護。