黃雀行動有兩本「數簿」，包括前線營救費用，以及民運人士在港等候外國政府接收期間的住宿、食用等開支。前者不能曝光，但賬目受最少三名核心成員嚴密監管，與支聯會無關；後者部份開支由支聯會支付。核心成員估計，整項黃雀行動的總開支約二、三千萬元。
部份黃雀行動的資金，來自「民主歌聲獻中華」。另一部份營救經費則由相關人士四出籌募。
若要把一名民運人士從北方帶到香港，約要30萬元；若從廣州偷運到港，收費約為「一個15萬、兩個25萬」。
按「人頭」計，最貴的交易是拯救在天安門發起絕食的學運領袖程真。她當時被船家主動救出，人到香港，「任人開價」。當時兩黃雀拿着一袋現金到旺角亞皆老街一間酒樓（小肥羊火鍋現址），「一手交錢，一手交人」。最大額交易則高達100萬元，一次過偷運近20人。
民運人士在港等候外國政治庇護時，支聯會曾給予生活津貼。支聯會1990年的工作報告曾提及「港支聯通過各種方法，協助有需要的民運人士前往其他國家生活，負責有關交通、異地接待和安頓。」
本報記者