六四事件20周年前夕，封從德在本港出版《六四日記》（簡稱日記），該書記載了他在六四期間的經歷，且更着重於外界不甚了解或多有誤解的學運組織內部情況，以及決策過程的描述，紀錄之詳細，描寫之真實，著名學者余英時不但為之作序，更讚嘆：「驚心動魄，一字千金！」
「子彈在頭上穿過」
封從德對本報表示，前不久香港大學學生會主席陳一諤被罷免，就是因為他對六四的認知，受到一些史料誤導，不了解真相，說錯了話，「所以我這本書除了要還原真相，更是寫給未來，讓未來不再誤讀歷史。」他還指，89民運的經驗對國內風起雲湧的民間維權，亦可提供借鑑，「當時我們連如何開會商量事情都不懂，更不用說跟當局對話，以及屠殺來臨時應變了。這些對維權者們，可以參考。」
日記不但對事件有理性剖析，也不乏驚心動魄的描述。如6月4日凌晨解放軍包圍廣場後，下令學生7時前撤走，「天安門廣場四周火光熊熊，槍聲此起彼伏」，「子彈在頭頂上空穿過，高音喇叭被打成蜂窩一般」，「有工人拿槍頂着柴玲：我的兄弟被打死了，你們學生要再說甚麼非暴力，我就一槍崩了你！」「也有學生拔出匕首大喊：誰對軍隊動手就是害大家，我先和他拚！」讀之令人驚心動魄。
日記還指出，中共當局從一開始，就在學運中安插自己人，讓他們偽裝打入學運核心，以關鍵時發揮作用，例如宣佈復課、取消大遊行、刺激學生製造燃燒瓶為當局鎮壓提供口實，甚至為日後流亡海外都有準備等，「我不好明指這些人是誰，我想說的是，六四這場記憶的戰爭，還未結束，或許只有在中共倒台後，才能天下大白！」