FBI自1908年成立以來，經常被指為查案而跟黑幫扯上關係，引發雙重標準爭議。
在胡佛（J.EdgarHoover）出任局長期間，FBI就因要借助黑手黨查案，令黑手黨勢力空前強大。在1964年，美國三名民權鬥士在密西西比遭殺害，FBI懷疑是三K黨所為，但苦無證據，連屍體都找不到。於是FBI付款給黑手黨頭目，教他們用槍逼嫌犯供出藏屍地點，這宗案後來更拍成電影《烈血暴潮》（MississippiBurning）。
1965年，FBI總部又默許波士頓探員聘用職業殺手和黑手黨老大做線人，並以不起訴作交換條件。為了控制當時英格蘭地區的罪案，更縱容黑吃黑。而為了包庇黑手黨線人，更准許他們做偽證，指控無辜的李蒙殺人，遭受牢獄之災33年，到2001年才獲得法院宣佈無罪。
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