台灣最高檢察署特偵組偵辦扁家涉四大弊案，已進入結案階段，檢方可能短期內偵結。但在這個時候，檢方亦開始將偵辦的焦點轉至前總統陳水扁與前國安會秘書長邱義仁身上，兩人被指為爭取台灣加入世界衞生組織（WHO）及維繫與巴拿馬邦交，成立兩個專案，合共涉侵吞2,500萬美元（約1.95億港元），有關款項更被指利用台灣「空軍一號」或專機出訪時，偷運到海外。
檢方調查發現，扁家所涉及的國務機要費案、海外洗錢案、新竹科學園龍潭購地案及南港展覽館案等，四宗案件的事證都已明確，檢察總長陳聰明日前召集高層開會，決議近日先偵結這批案件。特偵組同時認定扁家涉案的金額高達12億元新台幣（約2.8億港元），其中海外洗錢案及龍潭購地案佔其中很大部份。
邱義仁領走不連號舊美鈔
隨着四大弊案案情明朗化，檢方開始將重點偵辦侵吞外交密款案。據知情人士透露，陳水扁與邱義仁在執行500萬美元的「醫和專案」與2,000萬美元的「拉美專案」時，邱未按外交標準作業流程，而是直接下令要外交部提取現鈔，然後分批由他簽名領走不連號的舊美鈔。這些現金同時有可能利用阿扁出訪的機會，用台灣的「空軍一號」或專機，直接運到海外，存入他人開設的賬戶，藉以侵吞公款。由於兩個專案的款項，都是由邱當面交予指定人物，未有第三者在場，邱是否將款項交予指定人物，有待當局調查。
涉東南亞虛設辦事處斂財
檢方早前以邱義仁涉及「安亞專案」，詐領50萬美元而被收押，此外，檢方亦發現另有第四宗機密外交案，阿扁與邱涉嫌在東南亞虛設辦事處，藉以斂財，其中有上千萬美元下落不明。有檢察官表示，雖然，目前已就機密外交費案，兩度傳訊邱，但至今仍未提訊扁，檢察官又稱，機密外交費案將不會與扁家其他弊案，一同在年底前偵結。
對於有關指控，陳水扁辦公室昨日予以否認，並強調阿扁多次表示，外交部機密外交費應經內部程序簽報核准後執行，沒有任何一毛錢落入私人口袋，而邱義仁在阿扁擔任總統期間從未跟隨出訪，因此絕無由專機攜帶鉅款，再由邱親自交付的可能。
台灣《壹週刊》/台灣《蘋果日報》
話你知：拉美專案穩住巴拿馬
「拉美專案」及「醫和專案」，前者是指2004年巴拿馬民主革命黨的馬丁．托里霍斯（MartinTorrijos）贏得大選後，馬丁一直宣稱要與台灣斷交，與北京建交。由於巴拿馬是台重要邦交國，時任國安會秘書長的邱義仁提出以2,000萬美元政治獻金，鞏固邦交。事後，巴拿馬不但未與台斷交，巴拿馬更出現多次與台灣高層互動。後者是指2004年，爭取以台灣名義加入世衞的專案。扁為實現兩年內加入世衞，極力爭取，當得悉前外交部長錢復與南韓醫學界重量級人物ParkTung-San相熟，邱認為可透過這人替台灣發聲，於是分三批，將500萬美元交予Park。後來，國安會評估，認為專案的成效不彰，主動喊停。
扁家被查四宗弊案
《國務機要費案》
‧檢方認定扁夫婦等5人涉貪瀆，其中扁嫂利用假發票（圖）詐領1,480萬元
《海外洗錢案》
‧洗錢地點遍及五大洲，所採用的人頭戶包括扁嫂哥哥吳景茂（圖），扁子陳致中夫婦等，共逾7億元
《龍潭購地案》
‧扁家涉收受台泥董事長辜成允（圖）逾4億元
《南港展覽館案》
‧扁家曾收受力麒建設負責人郭銓慶（圖）9,000萬元
備註：貨幣單位新台幣
資料來源：台灣《蘋果日報》
點滴
扁家擬售高雄豪宅
陳水扁遭檢方收押後，扁家遷往高雄豪宅「人文首璽」的計劃生變。知情人士指出，扁子陳致中已取消搬家，並決定先完成豪宅的裝修，待樓價好轉時才出售。陳致中亦曾詢問姊姊陳幸妤是否有意先行南遷，但陳幸妤心裏頗不是滋味，最後以在台北工作為理由，回絕陳致中提議。
扁辦減薪長期抗戰
阿扁被收押後，他的辦公室隨即由前總統府秘書長陳唐山接掌、坐鎮，而文膽劉導則代理林德訓的主任職務。扁辦一年支付房租、幕僚人員薪金的開支合共800萬元新台幣，目前辦事處的財政雖然仍舊充裕，但扁辦人員為準備長期抗戰，近日有意一同自動要求減薪。