麥道MD-82客機被譽為第二最安全機種，出事的Spanair航空公司飛行安全紀錄良好，當局正分析已找到的兩個黑盒找出肇禍線索，美國亦派出五位專家到西班牙協助調查。調查員將焦點放在出事客機引擎上，也不排除人為錯誤。
出事客機曾作了兩次起飛，第一次是發現測量機身外的溫度儀有故障，被迫中止起飛，之後在第二次起飛時引擎着火爆炸，令人相信是機件故障所致。Spanair同款客機上周六也發生引擎故障，要緊急降落。
不過，航空專家利爾蒙特（DavidLearmount）指出，就算引擎着火，應該不會造成空難，因為機師可即時關掉引擎，就算已升空，也能控制飛機安全着陸。英航今年1月就試過兩個引擎失靈，機師也能控制飛機緊急降落，因此他相信事件應涉及人為錯誤。
另一名專家柯蒂斯（ToddCurtis）認為，引擎發生故障爆炸，導致全機失去動力，而機師可能太慌張不知如何處理，就是機師出錯。
在意外發生前一小時，Spanair機師威脅罷工，抗議母公司北歐航空計劃裁員1,000人，暫時未知這和空難有沒有關係。
美聯社/英國《泰晤士報》