兩鐵合併條例草案，在立法會終於以三十票贊成、十七票反對及一票棄權下三讀通過，而下一個難關是九月底舉行的特別股東大會，待小股東通過議案，兩鐵合併程序才算正式完成。
兩鐵合併，所產生的是協同效應。所謂「協同學」，英文叫Synergetics，是二十世紀七十年代物理學家哈肯（HermanHaken）所創，注重探討各種系統從無序變有序的相似性，一些看似完全不同的系統，卻有深刻的相似性，因而可以建立一套數學模型和處理方案，研究事物從舊結構到新結構具有何種共同規律有助發展。
其後美國戰略管理學家安索夫（H.IgorAnsoff）將協同理論引入企管領域，兩個企業合併後通過相互協作，可使企業的整體價值大於各獨立組成部份價值的簡單總和，即2+2不等於4，而是可能等於5。
古人說：「合則兩利，離則兩傷」，兩鐵合併，其協同效應是多方面的，合併後無論是人力、設備、資金、知識、技能、關係等資源，都為兩鐵共享而成本降低，此外還有營運情況，以及未來地鐵將擁有九鐵沿線多個物業發展權，實力更雄厚，而九鐵也會通過出售物業獲利。
可見兩鐵合併，車費要減是必然的，問題只在減費是否足夠，會否在減價後反會謀取暴利。另一問題是合併後許多職位變成重疊，部份非前線員工勢必會被裁掉，如何保障這些人的生計也應受關注。
然而凡事沒有絕對，協同作用也可以產生負效應，例如當行政失當而引起協調成本增加，市場應變速度遲緩或運作效率降低等，好事也會變成壞事。