溫家寶昨日從東京前往京都時沒有照例乘坐新幹線，而是選擇了乘飛機，惹來一些猜測。就未選擇乘坐新幹線的理由，外交部發言人劉建超僅稱「是出於中日兩國禮賓部門的安排」。也有猜測認為，由於中國境內反對引進新幹線技術的呼聲很強烈，溫刻意避開了乘坐新幹線。此前，中國已故領導人鄧小平、江澤民、朱鎔基等訪日時都乘坐了新幹線。