一九四九年，黃賓虹八十六歲，受聘杭州國立藝術專科學校教授。次年雖仍續聘教授，但屬於「暫不任課之教員」。學校以傳統山水花鳥畫不適應反映新生活為由，禁止學生觀摩、研習傳統舊畫，當時學校舉辦的師生畫展上，黃賓虹、潘天壽等老教授的作品都擺在不顯眼的位置，黃賓虹的山水畫掛在暗角裏，潘天壽的畫只能掛在走廊裏。有位老學生去看望黃賓虹，他一邊與客人談話，一邊作畫，黯然地說：「現在他們不需要我們這一套了，還不如回鄉種地。」
一九五一年十月，黃賓虹以社會人士身份應邀列席政協一屆三次會議，為代表中年最長者。會議期間，毛澤東向他敬酒，問他近來做些甚麼工作。他說在研究戰國文字，毛澤東也說自己近來愛讀周秦諸子。還有一位看似二、三十歲的人來談了好久，後來才知道原來就是周恩來總理。黃賓虹在北京逗留一個月，回杭州後，夏承燾去看他，見他忙於伏案作畫，「謂皆應京中當道者之求者」。不知道是哪些「當道者」，看來他們的客廳裏張掛的還是黃賓虹這樣的「舊畫」，並不是反映工農兵新生活的作品。
據王中秀《黃賓虹年譜》所記載，黃賓虹有畫贈周恩來，題詞：「武林古宕舟中所見，筆以追之。辛卯八十八叟賓虹」，又題：「恩來先生雅正，辛卯賓虹年八十又八」。兩年後的冬天，又作《南嶽山水圖》贈毛澤東，自題：「禹迹鐫南嶽，星輝拱北辰。降靈天應瑞，周甲日維新。圖畫開文運，舟車萃德鄰。還看勒金石，共祝八千春。潤之先生主席壽慶。黃山黃賓虹時年九十。」京中當道者中李濟深、陳叔通均為幾十年老友，黃賓虹每年都有畫贈送，陳叔通還代章伯鈞求過畫：「章伯鈞兄，皖人也，慕公畫，能否贈以疏林遠岫（署年歲）。弟代求，又點景，未免冒昧。然恃知愛，敢直陳之。」