對於陳水扁聲言要考慮廢除國統會，北京聯合大學台灣研究院院長徐博東抨擊，這只會再次向世人說明他說話不算數，也讓國際社會和兩岸同胞認清其台獨的真面目。他認為陳水扁的目的是要證明自己還沒「跛腳」，仍有能力製造兩岸議題。他相信大陸方面不會立刻隨之起舞，會在適當時機回應。
尋求歷史定位
民進黨在去年底的縣巿長選舉大敗後，支持度陷入低谷的陳水扁，調整政治路線和思路，最後決定向獨派靠攏，先是在元旦談話中表示緊縮兩岸經貿政策，然後是撤換在兩岸政策上持較務實態度的行政院前院長謝長廷，改由蘇貞昌組閣。
台灣政壇解讀，陳水扁為求在最後兩年任期尋求歷史定位，憲政改革無疑是最重要工程，而台灣立法院日前決議要求總統府內「非編制組織」如人權諮詢委員會等停止運作，恰好給他最好藉口，廢除同樣是非正式編制的國統會。陳水扁執政以來最重要的「四不一沒有」政治承諾，將面臨動搖。
台灣《蘋果日報》