東鐵列車由自動改為人手操作，原來九鐵共有兩套列車系統，包括自動列車操作系統及自動列車保障系統。 前者完全由控制室控制停車、到站等，司機僅在車廂內視察控制室輸送的訊息。後者則由司機操作，但只是操控列車駛入月台，當駛到月台時，司機只需按動掣鈕，列車便會自然減慢車速，打開車門上落客後，司機再按鈕便會關門開車，自動化程度仍相當高。