選戰緊張，連台灣總統陳水扁和行政院長謝長廷的關係也受到衝擊。陳水扁前晚接受電視台訪問時，撇清自己與高雄捷運弊案關係，指那是當時任高雄市長的謝長廷和高雄人的事；謝長廷昨日也撇清自己與弊案主角、總統府前副秘書長陳哲男沒有關係，暗指陳哲男與陳水扁才有關係。
謝長廷昨日回應傳媒追問時，坦承過往與陳水扁曾關係緊張：「過去的確有，阿扁沒有當選總統前，我們是競爭關係。」謝長廷說，他與陳水扁從來沒有互相關說任何人或事，陳哲男並沒有向他關說過。
扁、謝在三合一選舉後內閣是否改組問題上也說法不一，陳水扁前日表示選舉結果和內閣是否改組沒有必然關係，但謝長廷昨表示，「選後內閣一定調整，只是幅度問題。」
台灣《蘋果日報》