南京十運會的十二天賽事，傳出的醜聞可謂歷屆最多，讓金、買金、黑哨、內定、服禁藥等事件不絕於耳。上海巿體育局辦公室副主任蘇清明撰文稱，這次全運會爆出這麼多造假醜聞，「是官本位、金錢至上、狹隘的地方主義在作祟。」
這屆十運會最驚人的醜聞，是亞特蘭大奧運女子柔道冠軍孫福明，在決賽遇到解放軍小將閻思睿，但在開賽後僅幾十秒便被對手摔倒在地。賽後她公開承認，是遵從教練的安排在比賽中假摔。大會事後裁定賽果無效，但在重賽孫再次落敗。
而香港羽毛球手王晨在女單銅牌爭奪戰中，因連番遭裁判不公正判決，開賽不久後便宣布棄權。她賽後直言，準決賽時最少被裁判錯判五個球，反正無論對誰自己都會被「做掉」，不如棄權以示抗議，更揚言以後絕不到內地參賽。
本報記者