台灣國安局長薛石民表示，神六擁有偵查衞星功能，能拍攝地面細小至十五厘米範圍內的高解像照片，台軍必須作出防範，以避免島內的軍事設施遭大陸窺探。
能拍15厘米高解像照片
日本《朝日新聞》報道，神六今次升空負有軍事偵察任務。神六的軌道艙與返回艙分離後，仍會繼續在太空運行半年，其間將透過安裝在艙外的高性能相機，拍攝台灣、美國和日本的軍事設施。
薛石民前日回應有關報道時直指，神六所擁有的偵察能力，無異於有一顆鏡頭解像度達十五厘米的偵察衞星，對台灣有很大影響，島內的軍事設施有需要加強偽裝保護。
加拿大「漢和防務評論」總編輯平可夫表示，以神六的體積來看，絕不可能裝上解像度達十五厘米的巨型鏡頭，但從神六的發射轉播狀況顯示，中國已完全掌握數碼衞星影像即時傳送技術，再加上飛行中兩名太空人可分工合作，使得遙控困難的手動拍攝成為可能，要進行類以間諜衞星的精確拍攝並不困難。
《中國報報》