反恐專家表示，種種迹象顯示，跟「恐怖大亨」拉登的阿蓋德組織有連繫的「伊斯蘭祈禱團」（JemaahIslamiyah，JI），策動前日峇里襲擊的嫌疑最大，雖然○二年峇里大爆炸後，該組織精神領袖巴希爾已經被捕，但百足之蟲死而不僵，前天的襲擊顯示，JI吸納新血的能力並未受影響。
仍成功吸納新血
除了造成逾二百人死亡的○二年峇里大爆炸外，JI也涉嫌策動前年耶加達萬豪酒店襲擊和去年澳洲駐耶加達大使館襲擊，包括巴希爾在內的數十名重要成員相繼被捕，但目前仍有至少十五名核心分子在逃，活躍在印尼、泰國和馬來西亞。
雖然前天的連環爆炸仍未有組織承認責任，但新加坡反恐專家古納拉特南指出，只有JI才能在印尼進行有組織襲擊：「毫無疑問是他們所為，沒有其他組織能策動那樣的多重襲擊。」澳洲反恐專家威廉斯指出：「JI仍有能力策動小規模襲擊，前日的襲擊很可能有六人同時執行襲擊。」
正在獄中的巴希爾透過發言人指跟襲擊無關，威廉斯認為，馬來西亞籍的JI成員阿扎哈里（Azahari）和努爾丁（Noordin），很可能是今次襲擊的主謀。另外JI的阿蓋德聯絡人漢巴利（Hambali）前年被捕後，被指接替他為JI行動主管的祖卡南，也可能是今次襲擊的黑手。
古納拉特南指，JI再次挑戰峇里作為襲擊目標，是要傳遞一個訊息：即使多名成員被捕，組織仍活躍和有能力策動襲擊。「他們選擇峇里，是想令印尼尷尬和受辱。」他說：「尤其是在有報道指JI已被瓦解後，他們便要證明JI仍有能力。」威廉斯說，襲擊「會鼓勵更多人加入他們。」
美聯社/英國廣播公司