峇里島再次受到連環爆炸襲擊，最有嫌疑策動襲擊的組織，自然是三年前的十月，襲擊峇里炸死二百多人的伊斯蘭祈禱團（JemaahIslamiah）。
伊斯蘭祈禱團與「恐怖大亨」拉登的阿蓋德有聯繫，屬於阿蓋德在東南亞的分支，八十年代末至九十年代初由印尼激進回教分子創立，成員主要分布在印尼、馬來西亞、菲律賓、新加坡和泰國，柬埔寨、越南以至澳洲亦相信有小量成員。
伊斯蘭祈禱團的主要目標，是在區內各地建立伊斯蘭政府，然後組成一個統一的東南亞伊斯蘭國家。
伊斯蘭祈禱團首次受到國際關注，始於新加坡在二○○一年底發現該組織計劃襲擊當地本土和外國目標。翌年峇里大爆炸令該組織恐怖名聲遠播，東南亞各國政府大舉拘捕伊斯蘭祈禱團超過二百名成員，包括精神領袖巴希爾。
15核心成員在逃
不過，伊斯蘭祈禱團仍然有能力發動恐怖襲擊，包括前年印尼耶加達萬豪酒店爆炸案，以及去年九月澳洲駐耶加達大使館爆炸案。區內情報消息人士估計，伊斯蘭祈禱團仍有十五名核心成員在逃，而且吸納新血能力未受大影響。
在逃頭目當中，以馬來西亞籍的阿扎哈里和努爾丁最受關注，兩人被指是策劃伊斯蘭祈禱團多次襲擊的主謀。阿扎哈里曾是工程師和大學講師，九十年代在阿富汗的阿蓋德訓練營將自己的專長用於製造炸彈，努爾丁之前任職會計師。印尼總統尤多約諾月前指兩人在逃，隨時會發動襲擊。
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