身兼特首選舉委員會委員的柯清輝，對剛獲中央任命的行政長官曾蔭權「充滿信心」，認為對方是眾望所歸，兼熟悉公務員及政府運作，對其未來施政大有幫助，在提名過程中給了曾氏一票的柯清輝指出，新特首決策果敢決斷，不是「婆媽的人」，盼望他可以「改變人哋話我哋議而不決的形象」。
支持銀行界入行會
市場傳聞曾蔭權將擴大行政會議成員，並邀請包括滙豐亞太主席鄭海泉入局，被問及是否同意加入銀行界代表，柯清輝對人選揣測不作評論，只表示新特首多番強調，香港金融中心地位非常重要，若然如此，他反問「行會是否需要金融界嘅人」，道理是否顯而易見。
上月底才從滙豐調升恒生大班的柯清輝笑說，剛「嚟到呢個位」，就收到一封客戶來函，令他哭笑不得，「佢話我喺滙豐度成日刪分行，嚟到恒生就唔好再刪」，因此對於恒生會否刪減分行的敏感問題，要格外留神，收信後他說，就算本來想減，「當堂都要諗過先」。
恒生與滙豐雖屬同一集團，但獨立發展各有定位，恒生早前就曾與滙豐，在上海為一個好行址「爭崩頭」，最後恒生爭贏，他說「嗰時我重喺滙豐」。回頭看輸即是贏，確有遠見。