台灣藍營（國民黨、親民黨、新黨）、綠營（民進黨、台聯）支持者在機場流血衝突，不只是兩派贊成連戰訪問大陸與否的反應，也是省籍矛盾、台灣社會長期割裂、積怨甚深的一次爆發。台灣學者認為，帶頭的政治人物應負責任。
台灣大學城鄉研究所教授夏鑄九指出，這次衝突是去年總統選舉後兩派選民激化的情緒延續到現在，並且藉由連戰出訪爆發出來。他批評：「都是這幾年選舉，政治人物操弄（省籍）認同議題的結果，讓民眾在短期間裏，像着了魔，才有這樣誇張的表現！」
淡江大學公共行政系教授施正鋒也強調，藍、綠兩派人馬到機場送行，原本應該只是象徵性的動作，「丟雞蛋勉強可以接受，但最後竟然演變成暴力衝突，有仇恨，才會流血，民眾的行為已經到了發洩的程度，背後的因素還是長久累積的族群分歧問題。」去年三月總統選舉，民進黨陳水扁只以些微優勢壓倒國親聯盟的連戰、宋楚瑜，藍營支持者曾在總統府外抗議多日，並爆發多次警民衝突。
不過，台灣世新大學通識教育中心教授李筱峰認為，這次衝突未必是大選對立氣氛的延續，而是長期以來對國家認同的分歧。
台灣《蘋果日報》