蔣經國在一九三九年至四五年出任贛（江西簡稱）南專員時，與其秘書、浙江女子章亞若發生婚外情，章並為他誕下私生的孿生子章孝嚴（現任立委）和章孝慈。雖然蔣方良在蔣經國在生時，一直對丈夫的不忠不聞不問，但這仍是一生中對她打擊最大的事情。
蔣方良三子蔣孝勇生前表示，蔣經國在贛南工作時，經常帶部屬、朋友回家，其母親應與章亞若見過面。當年在贛南有關蔣、章的婚外情就傳言紛紛，但是蔣方良從沒過問，蔣經國還對傳聞持否認的態度。
一九四二年，章亞若病逝。蔣孝勇相信，蔣方良「是到台灣以後才知道章孝嚴、章孝慈的事」，因為當蔣經國去世後，傳媒常有報道章氏兄弟認祖歸宗之事。蔣方良知悉後向他追問，他只好說：「這件事情爸爸生前沒有交代！」他費了很大功夫解釋，但母親還是頗傷心。
台灣《蘋果日報》