雅典奧運除面對保安和罷工問題，當地空氣污染問題也備受關注。美國奧委會已做好準備，以防運動員在戶外比賽時，因空氣污染引致呼吸系統毛病，影響表現。
雅典近年人口上升，加上缺乏完善城市規劃、汽車和工廠排出廢氣，空氣污染問題愈來愈嚴重。美國奧委會生理學家威爾伯表示：「這樣可能影響運動員表現，視乎運動場地和甚麼體育項目。」
他早於去年五月已派員到雅典不同比賽場地量度空氣質素，讓運動員和教練有所準備；他又建議運動員賽前幾個月到空氣污染環境訓練幾次，若有呼吸系統毛病，也可預早治療。
但雅典市長巴科揚尼斯強調情況改善了，「雅典好多年前被評為污染城市，但那是二十五年前的事，現在雅典空氣不會影響運動員」。世界自然基金會亦予以高度評價。
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