【本報訊】陳水扁及呂秀蓮的槍擊案仍然充滿疑團，當天負責保衞的七百名國安局特勤人員（特工），不但未受任何懲處，還獲發高達三百萬元新台幣（約七十五萬港元）的獎金。有關高層還要求下屬人員上報「當天有功人員」的名單，實在匪夷所思，也因而受到社會的猛烈抨擊。
台灣《時報周刊》報道，對於國安局近日發放獎金給保護陳水扁及呂秀蓮的特工，有特勤人員坦言有點訝異︰「總統、副總統都被槍擊了，現在還捉不到兇手，卻要填報『有功人員』名單，有沒有搞錯？誰敢說自己有功啊？傳出去不怕被打死才怪！」這名不願意透露姓名的特勤人員透露，這筆名義上稱為「作業金」的經費，全部來自國安局，派發的人員包括當天負責正、副總統安全的警衞勤務的第一線執勤人員，約有七百人，即每人四千多元。
由於國民黨立委稱這筆錢是「掩口費」，國安局昨天下午召開記者會澄清。副局長黃磊表示，「作業金」實質金額為二百五十萬元新台幣（約六十二萬五千港元），一早列入大選的保安預算，三月十九日槍擊案發生前已發放。他解釋該筆錢是用在大選前後共六十天的「維安３號」方案，也就是特勤人員保護兩組正副總統候選人安全的超時津貼，並非「獎金」。
另外，國安局根據刑事局專案組提交的報告，認為槍手對土製手槍性能有專業知識，而且局內有特工曾大額下注大選賭盤，不排除有特工與地下賭盤的莊家勾結作案，以贏取賭金。目前已鎖定目標，清查所有出勤、軍、警、憲、調特勤等人員的銀行帳戶，看是否有不明資金進出，是否有人涉及簽賭。