台南縣和高雄地區佔這次大選的廢票逾半，達到十七萬張，引起高雄市民的強烈關注，不少人認為選舉過程疑點重重，中間選民也表示，盼陳水扁能夠公開驗傷，看他的傷口是否槍擊造成，而法院和中選會能夠盡快展開驗票程序。
不願表達政治立場的高雄市劉先生認為，連戰和陳水扁做總統都無所謂，但選舉前發生的種種事件，叫他不能信服。他提出三疑點︰「第一，參加公投的人才會支持陳水扁，為甚麼公投率只有百分四十五，陳水扁的得票率卻超過百分五十；第二是陳由豪事件未明，第三是選前一天發生槍擊案，在案件未查明真相前，選舉卻如期舉行？」
高雄縣路竹鄉的村民謝嘉峻，上屆把票投給陳水扁，由於不滿陳水扁沒有兌現當年的競選諾言，加上吳淑珍炒股票和陳由豪等事件，使他決定把票投給連戰。他也質疑，陳水扁在高雄縣巡視時，親眼看到他有穿防彈衣，到台南縣卻脫掉︰「而且一脫掉防彈衣就中彈，怎麼會那麼巧呢？狙擊手那裏不打，偏打呂秀蓮綁着厚厚繃帶的右膝，又那麼巧？阿扁傷口只差一公分就傷到腹腔，怎麼又那麼巧合呢？太多疑問了！」他表示︰「陳水扁經常強調他是個公平、公正的人，今天我們就要求公平、公正、公義的答案。」
台北高等法院昨晨七時受理國親提出的「選舉無效」訴訟後，高雄地方法院派出三組法官和執案人員，到市內各投票所封箱，發現苓雅區一百一十個投票箱中，八成被發現有瑕疵和漏洞。到場協助封箱的選務處職工沈慧惠透露，他們發現部份投票箱沒貼上封條，即使貼上封條後也沒蓋封印，不排除有人對票箱動過手腳。選務處人員表示，他們會把相關資料上交地院，以供驗票參考。
記者：陳敏莉高雄市報道