馬寅初一九五一年出任北京大學校長。一九五四年當選全國人大常委。一九五七年發表《新人口論》。一九五八年被點名批判。一九六○年被迫辭職。十九年後平反為北大名譽校長，重新當選全國人大常委。一九八一年當選中國人口學會名譽會長、中國經濟學團體聯合會第一屆理事會顧問。一九八二年在北京逝世，享年一百○一歲。
照北大畢業的錢文輝說，一九五八年屢遭點名批判期間，馬寅初校長在全校大會上說他不在課堂上教書，「但我要用自己的文章來教育北大學生堅持真理」：「我總希望北大的一萬零四百名學生在他們求學的時候和將來在實際工作中要知難而進，不要一遇困難便低頭」。一九五八年五月四日北大六十週年校慶，陳伯達到北大公開點名要馬寅初對《新人口論》作檢討。接着，北大所有刊物和全國各地報紙猛烈批判新人口論。馬寅初拒不檢討，堅決不寫檢討文章，照常笑咪咪出入住所燕南園，圓圓一張臉像彌陀。
錢文輝〈追憶北大師容〉第六節說馬校長是「一位全體北大學子的老師」，我讀了想起春節前台北友人寄給我看的馬寅初小條幅照片，說是他在北京一家老字號裏買到的，不知是真品還是贗品。我說我不熟悉馬寅初的字；馬寅初既不是書法家，造假不足牟利，應該是真的。我是六十年代末期偶然聽唐錫如先生談起《新人口論》才找出一些馬寅初的文字細看，唐先生後來還借了一本《馬寅初演講集》給我參考。
我不懂經濟學不懂人口學。馬寅初的論點說控制人口降低消費才能積累資金；說中小型工業拖慢高速度工業化的進程；說人口一多糧食長期緊張必然影響重工業發展；說中國全國人均只三畝地，不控制人口人民吃不飽要出大亂子。正確不正確我不知道，專業知識才能判斷；馬寅初拒絕接受的是政治干預學術和政治審判學術。在這樣一片整肅風雲籠罩下，重要的是馬校長頂着天立着地向霸道的極權說不。
那不是搞對抗；那不是不愛國；那不是向一個政權施展惡毒的衝擊：那是對自己的祖國發出理性的建言。北大校園貼滿批馬大字報的時候，全國上下跟着指揮棒一致狠批這個知識分子的時候，一九六○年第一期《新建設》上刊出馬寅初寫的〈重申我的請求〉。他說他不做沒有把握的研究工作，不亂寫文章，既然寫了，就要承擔責任，錯了也要勇於改正。「是真理要堅持，即於個人有所不利，亦該擔當一切後果」。他說他是年近八十的人了，「明知寡不敵眾，自當單身匹馬，出來應戰，直到戰死為止，决不向專以力壓服不以理說服的那種批判者們投降」！黑夜中，燕南園窗紗裏洩出來的那一暈燈影是莊嚴的。
（圖）趙治民繪劉備張飛關羽夾攻呂布手卷（局部）
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