侯賽因被擒，是美國在反恐戰中所取得的一次重大勝利，令美軍可重新把資源調回阿富汗對付另一大敵──沙地阿拉伯裔恐怖大亨、恐怖組織阿蓋德首領拉登。英國《太陽報》引述情報消息報道，美國已鎖定下一個目標是擒殺拉登，「不論生死，他將是重要戰利品，因為他的追隨者相信他是不朽。鏟除他，阿蓋德的勢力將會一蹶不振。」但捉拉登比捉侯賽因難得多。
美國駐阿富汗大使哈利勒扎德就坦言：「侯賽因不再是問題癥結，拉登已成焦點所在。」駐阿富汗的美軍發言人希爾弗迪強調，侯賽因落網將「鼓勵了人們，向我們提供打擊阿富汗敵人的情報」。
不過，反恐專家大潑冷水，指美軍要搜捕拉登和副手扎瓦希里，比捉拿侯賽因難，即使知道兩人身處阿富汗和巴基斯坦邊境山區，還是奈何不了兩人，兩人仍繼續遙控策動恐怖襲擊，試圖獲得「骯髒彈」和其他大殺傷力武器，令美國及盟友寢食難安。
卡內基基金的反恐專家哈卡尼就說，美國同樣懸紅一億九千五百萬港元緝拿拉登和侯賽因，但至今都沒有阿富汗人為了懸賞出賣拉登，拉登可不像侯賽因是個「暴君」，他不孤立無援，反而深得當地人支持，而且「美國人沒有給阿富汗人甚麼恩惠，當地人都視他為英雄，給予保護」。另外，阿富汗和巴基斯坦的地方政府和居民，在意識形態方面都認同拉登，加上阿蓋德組織嚴密，令美軍即使在阿富汗和巴基斯坦中央政府的支援下，始終難以追蹤到拉登的下落。
有美國官員甚至指出，即使美軍最終能擒殺拉登，也不等於反恐戰勝利，因為阿蓋德有着「久經訓練的嚴密組織，一小撮人暗藏世界各地，斬掉首腦，不等如身體死亡」。
專家亦警告，侯賽因被捕，只會給美軍士氣帶來短暫心理鼓動作用，不會迅速瓦解伊拉克游擊隊行動，帶來長久勝利，因為游擊隊不是為侯賽因而戰，而是出於民族大義反美。
美國還有其他大敵在逃，包括包庇拉登的阿富汗前塔利班政權精神領袖奧馬爾、前波斯尼亞塞族領袖卡拉季奇和姆拉迪奇，以及侯賽因副手易卜拉欣等十三名通緝犯。
路透社/英國《太陽報》/《泰晤士報》