宋美齡身後，已完成了公祭、蓋棺、移靈。目前安厝在紐約上州芬克里夫墓園。後天（十一月五日）會舉行追思禮拜。但即使追思禮拜過後，宋的身後事也還沒有完全落幕。
其一是，靈柩最終應安葬在哪裏，親屬中有的主張運回台灣，與蔣介石靈柩合放在大溪慈湖，也有人引蔣介石日記，望百年後葬於南京，那麼，在芬克里夫墓園的宋美齡靈柩是暫時安放還是永久安置，也就未最後確定。
其二是靈柩覆蓋中華民國國旗的問題，原先陳水扁表示趁訪美之便，要親往紐約為宋的靈柩覆蓋國旗，但蔣家孫媳婦蔣方智怡認為陳水扁連中華民國的國號都有否定之意，豈能由陳水扁覆旗？豈能在大選前給阿扁「做秀」的機會？於是在美的宋氏家族，乃改口稱願由連戰覆旗，但連戰不能代表中華民國政府，於是折衷妥協，決定提前公祭及移靈，陳水扁來美則收下陳水扁代表政府所頒之國旗，只是國旗已不能覆棺，於是由家屬把國旗再帶回台灣，置放於大溪慈湖，家屬稱這樣的意思是：蔣夫人雖不能回來，但她的心意已回去了。
只不過這面國旗是不是即代表宋美齡已與蔣中正長相左右了呢？實在令人懷疑。此舉也讓人感到有點莫名其妙。
更奇怪的是：十月二十七日殯儀館才宣布，家屬定下在十一月一日開放給各界追悼，並瞻仰宋美齡的遺容，但孰料二十八日卻突然改為提早大殮、封棺，並快速出殯，同時取消了十一月一日的瞻仰遺容日程。這一做法，似是為了趕在陳水扁抵美前完成一切殯儀，以免阿扁乘機藉出席喪禮而自我宣傳。
宋美齡已走完她的跨越三個世紀的人生路程。實際上，她早在一九七五年蔣介石去世時，已選擇了淡出政壇。這以後，她多居美國，縱然回台灣，也保持着對政治關心而不插手的態度。僅有的一次，只是在蔣經國去世的一九八八年，她曾寫信給國民黨中央黨部秘書長李煥，提議暫緩選出新的黨主席，但在中常會推舉李登輝任黨主席後，她也淡然處之，展現出對在前台掌政者的尊重。辜振甫曾有名言：一個人退下舞台時，背影要優雅。宋美齡從舉足輕重的地位一旦離開政治舞台，可稱退得極為優雅。她不接受訪談，不寫回憶錄，安然度她的晚年。中國的政治人物，難得有她這樣的風度。
只可惜在她溘然長逝之後，因兩岸關係，尤其是台灣的政治紛爭，而搗亂了她身後的安寧。中國大使被拒，殯禮倉促舉行，國旗繞地球大半圈又回台灣，靈柩未定最後安葬地，都顯示現實政治的紛擾與粗鄙，使人為這優雅女士的身後事而感到欷歔。