1998年中，當時有「cyberkid」之稱的李澤楷，以旗下盈科拓展集團的名義，向政府提出興建數碼港的構思，並建議政府以公共工程計劃的形式興建數碼港，但政府認為自行興建不能確保資訊科技界的一流企業會遷入該港，同時亦不欲承擔發展計劃的龐大資金，故希望由私營機構帶頭發展有關計劃。
盈拓於98年底向政府正式遞交修訂建議，並提出把附屬物業發展項目（即現時的貝沙灣）列入數碼港計劃內，有關的收入將用以發展數碼港。
前任財政司司長曾蔭權在99年3月公布預算案之際，正式表示政府有意進行數碼港發展計劃，目標是要在最短時間內吸引一流的IT公司和人才滙聚香港，並要將之成為香港的資訊科技旗艦。
不過，政府在沒有招標的情況下，與盈拓於1999年2月就數碼港的發展綱要達成協議，意向書的條款主要包括「盈拓負責數碼港的一切建築費用（估計130億元）」。
不過，透過出售住宅單位以抵銷部份費用，盈拓最多只須出資約70億元。
政府與代替盈拓簽約的盈科數碼動力（1186）其後在2000年5月17日簽署協議，正式將發展權交給盈動。事件隨即引起巨大的爭議，政府當時被各界狂轟「偏幫李家」。
今日，第1及2期寫字樓已竣工，至今共有22個租戶，第3及4期（即3座餘下部份及4座）則會在明年初及明年中竣工。今年1月，貝沙灣1期開售，亦已售出逾九成單位，第2期則預期在今年底開售。