宗教界一直反對從胚胎抽取幹細胞作研究，況且研究需要大量人類卵子進行研究，可能引發窮人「捐卵」賺錢的商品化問題。但人造卵子技術可大量生產卵子，卵子商品化問題便得以解決。
一旦能以人造卵子作生育或複製器官用途，涉及的道德問題是另一種「先有雞抑或先有蛋」問題。人造卵子源自胚胎幹細胞，而這胚胎幹細胞來自受精卵，這始終是男女結合下製造的新生命。
另外，男同性戀者將來或許透過這技術，誕下有他們基因特質的愛情結晶品，打破了必須男女結合產子的難題，但卻衍生誰是嬰孩生母的倫理問題。
新技術也令人擔心世界進入新優生學時代。科學家透過基因改造工程，掌握了增減幹細胞內某些基因來改變遺傳因子，可因應父母的要求，製造出他們理想中的子女，爭相製造優秀下一代的危險。
美國《華盛頓郵報》