非典型肺炎在社區爆發，令本地經濟受到嚴重打擊，零售、旅遊、酒店等行業受影響最甚，業界寄望肺炎事件能盡快解決，令業務得以恢復正常。
重災區之一的旅遊業界的皇朝旅遊董事布漢銘指出，4月生意根本不用做，來自內地的旅行團已有八成取消；而港人前往廣東省的更全面停頓，即使港人的本地一天團都延至5月。至於會否影響到五一勞動節，他表示，目前港人出外或國內旅客來港均未有成團，大家仍在觀望事態發展。
周大福珠寶金行行政部副經理黃劍文亦認同，4月自發生淘大事件後，便開始人心惶惶，打擊消費意欲，該行的生意額較去年同期下跌30%，來自國內及本地消費者的需求均告下跌，加上世界衞生組織呼籲全球旅客避免來港旅遊，相信來自旅客的業務進一步下跌。至於會否影響至五一勞動節黃金檔期，他認為視乎事件能否受控制，相信當信心回復後，情況會改善。
非典型肺炎事件令市民注重健康，帶旺了保健藥品和診所生意，不過卻增加了保險公司的醫療保險賠償金額。亞洲保險董事總經理王覺豪預期，市民近期求診數量增加，預期機構客戶的醫療索償相應增加，暫時難以預測增幅。