雖然財政司司長梁錦松指出，上市監管權轉移不會影響港交所（388）的盈利，但全面收緊監管尺度，可能令新上市公司數目及炒賣活動變成「水清無魚」，最終導致港交所業績下跌。
不過，專家小組主席甘雅隆指出，交易所的監管責任既然減少，員工支出也可降低，他與小組成員祈炳達均認為，港交所既屬商業機構，政府就不能對其利潤作出保證，而且即使上市局批准某公司上市，但港交所仍有最終決定權，其情況就像俱樂部的會員申請入會一樣。
不過，諷刺的是兩年多前，港府要求聯交所及期交所合併及重組，就是因為不滿他們的經營方式像俱樂部，如今卻要他們打回原形！祈炳達認為，水清未必無魚，也不同意金融從業員因今次改革而失業，他說，海港乾淨了，可能吸引更多大魚回來。
為保持香港金融中心競爭力，專家小組建議，短期內上市局及港交所的總收費，不應超過現時港交所收取的上市費用，至於具體各自分開收，抑或集中收取後按監管責任分帳，則要兩家監管機構商議後才決定。
另外，小組指出，證監會上市局編制約達115人，因雙重存檔制聘請的15名職員可任核心人員，其餘人手可盡量聘請港交所上市科職員，聘用條件整體上應盡可能不低於港交所的聘用條件。不過，小組已估計未必全部上市科人員可以或願意過檔。