專家擔心西湖隧道工程除在風格上與西湖格格不入，還可能對西湖造成致命損害，如滲漏、西湖湖底沉降等，令人憂慮西湖隧道工程會否比西湖西進工程，對西湖申報聯合國「世界文化遺產」帶來更多的不利影響。
目前除興建西湖隧道外，近期還啟動「西湖西進工程」，搬走西湖西部的工廠、住宅等，開挖農田，令西湖水域擴大四分一，同時增六個景區，以容納更多的遊客。估計西進工程完工後，每年可多容納三十多萬遊客，旅遊收益一億六千萬元。
按西湖風景區保護條例，風景區建築物要與區內自然及人文景觀相協調，而外圍保護地帶的建築物亦不得有礙西湖景區的觀瞻。但這些工程全部都是破壞西湖的，以致當局現時不敢大張旗鼓的將西湖申報世界遺產。
專家指出，若說西進工程有「退耕還林」意味，那麼西湖隧道工程就完全違背西湖的總體風格。國內傳媒上月已指出，杭州市的政協委員鑑於西湖一帶旅遊旺季時車滿為患，提出要在湖底建大型停車場，但意見最後在一片反對聲中石沉大海。可是，與湖底停車場異曲同工的湖底隧道卻在無聲無息中上馬，令外界大為詫異。