選前民意調查一直認為可以囊括台北、高雄兩個直轄市市長寶座的國民黨，最後卻功敗垂成。雖然繼續維持台北市的管轄權，但未能殺入民進黨的根據地高雄市。國民黨這次在高市落敗，說明民進黨在南部的根基仍十分穩固，即使泛國民黨勢力整合成功，而在選前三天謝長廷還爆出政治獻金醜聞，也動搖不了民進黨。
國民黨副主席吳伯雄對黃俊英未能勝選感到惋惜，吳伯雄認為，高雄敗選是「受到在野整合太晚的影響，並受制於高雄市的政治生態。」對於親民黨主席宋楚瑜在最後關頭公開挺黃俊英，吳伯雄表示：「國民黨只有感謝。」
其實選前三天爆發的政治獻金案，對謝長廷的殺傷力巨大。民意調查顯示，政治獻金案曝光後，其對手黃俊英的支持度已從後趕上，並曾超越謝長廷，昨日投票結果卻再次證實，本來屬於民進黨根據地的南部地區，絲毫沒受政治獻金案影響，選民仍然將選票投給民進黨的陣營。
當然，謝長廷順利蟬聯，關鍵在於排除對手質疑，北上查帳釐清真相，重獲市民肯定，加上有「前、後任總統」支持，聲勢自然不同。
不過，台灣聯合報民調中心主任周祖誠指出，泛藍軍在高雄整合成功，仍未能擊敗謝長廷，對泛藍軍來說是好事。他說：「這次如果勝選，將是泛藍軍分裂的開始。」因為勝選會令泛藍軍人人認為可以輕易擊敗陳水扁，從而人人希望出戰而難以協調。
親民黨秘書長鍾榮吉昨晚表示，台北市長馬英九由於政績受肯定，整合及早完成，因此順利連任，相反高雄市長候選人黃俊英整合「起步較晚」，過程複雜，才沒有成功，但也顯示「在野整合是邁向拒絕民進黨執政的重要努力方向。」
中央社/記者楊清奇台北專電