台灣行政院陸委會的評估表明，兩岸直航的最大輸家將是香港，生產總值會因此下降百分零點零四，而台灣則是最大贏家，而且對大陸的經濟也有正面影響。
陸委會綜合交通部、經濟部、國防部、農委會等部委的評估後得出結論，指兩岸直航可節省航運費百分十二至百分四十二，台灣的GDP（本地生產總值）將因此增長百分零點三六，大陸將增長百分零點一四，而香港會降低百分零點零四。就直航影響貿易條件、社會福利、貿易盈餘進行的評估亦都顯示，台灣受益最多，香港成最大輸家。
另外，台灣中華教授協會昨日公布的民意調查顯示，逾六成受訪者認為兩岸「三通」將會有助台灣的經濟發展，認為沒有幫助的約佔兩成三；認為「三通」有急迫性的佔三成三，認為無急迫性的佔四成三。
同一調查還顯示，逾四成受訪者認為兩岸迄今無法直航的阻力主要在台灣政府，認為總統陳水扁有誠意實現「三通」的不足三成（見表）。
《聯合晚報》/中央社